Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Apoa1Q00623 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms