Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms