Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IhhP97812 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IhhP97812 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IhhP97812 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IhhP97812 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IhhP97812 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IhhP97812 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IhhP97812 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IhhP97812 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IhhP97812 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms