Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tarbp2P97473 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms