Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms