Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme1P97371 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme1P97371 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms