Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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