Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms