Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms