Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms