Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NficP70255 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NficP70255 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms