Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms