Protein–RNA interactions for Protein: P70194

Clec4f, C-type lectin domain family 4 member F, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4fP70194 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clec4fP70194 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4fP70194 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4fP70194 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clec4fP70194 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clec4fP70194 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms