Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx1P63006 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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