Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmc1P62192 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms