Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms