Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CirbpP60824 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms