Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms