Protein–RNA interactions for Protein: P59808

Sash1, SAM and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash1P59808 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sash1P59808 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sash1P59808 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sash1P59808 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms