Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms