Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms