Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csrnp3P59055 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms