Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms