Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms