Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms