Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms