Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms