Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms