Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rp1P56716 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rp1P56716 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rp1P56716 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rp1P56716 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rp1P56716 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rp1P56716 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rp1P56716 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rp1P56716 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rp1P56716 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rp1P56716 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rp1P56716 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rp1P56716 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp1P56716 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp1P56716 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rp1P56716 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms