Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lim2P56563 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lim2P56563 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms