Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms