Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GemP55041 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GemP55041 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GemP55041 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GemP55041 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GemP55041 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GemP55041 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GemP55041 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GemP55041 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GemP55041 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GemP55041 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms