Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Map3k1P53349 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms