Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Dbx1P52950 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Dbx1P52950 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Dbx1P52950 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Dbx1P52950 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dbx1P52950 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Dbx1P52950 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Dbx1P52950 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Dbx1P52950 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dbx1P52950 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dbx1P52950 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dbx1P52950 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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