Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms