Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbrP50284 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbrP50284 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LtbrP50284 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms