Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl5P50228 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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