Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms