Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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