Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms