Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca1P48754 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca1P48754 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca1P48754 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms