Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcd1P48410 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms