Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gli1P47806 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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