Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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