Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd1P40201 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd1P40201 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd1P40201 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms