Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf2P39429 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf2P39429 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf2P39429 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf2P39429 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf2P39429 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms