Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik2P39087 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms