Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprkP35822 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprkP35822 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprkP35822 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprkP35822 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms