Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms