Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifnar1P33896 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnar1P33896 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms